無土栽培與土壤栽培的溫室環境有所不同，無土栽培一般都實行地面隔離，室內環境受土壤的影響比較小，溫度、濕度、二氧化碳濃度變化幅度會更大，濕度忽高忽低和二氧化碳濃度不足是影響無土栽培作物生長的最大因素。
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1、無土栽培溫室的光照、溫度、濕度、二氧化碳的同步管理非常必要，必需配套升、降溫設施、噴霧加濕設施、增施二氧化碳設施及通風、補光設施等，創造適宜而又持續穩定的生長環境是實現無土栽培作物獲得高產和優質的重要保證。光照增強時溫度、濕度、二氧化碳可適當偏高管理，光照減弱時這些指標就應偏低管理。
2、溫室無土栽培作物當光照強度超過40000lx，室內溫度也超過35℃，如果此時空氣相對濕度低于40%，將使植株蒸騰作用過于旺盛，體內水分代謝失去平衡，黃瓜瓜條易出現彎曲、束腰和缺乏光澤、口感不脆等品質問題，嚴重時植株葉片變小，葉緣枯黃、生長點萎縮，影響正常開花結果。西紅柿、彩椒最顯著的傷害就是出現果實“臍腐病”和生長衰弱。同時，高溫、強光、干燥、低濕還容易加重蔬菜病毒病和白粉病的發生。